La UNM integra el Consejo Interuniversitario Nacional (CIN). También participa en las redes constituidas por el CIN y otras de importancia territorial, como la RUNCOB – Red de Universidades Nacionales del Conurbano Bonaerense- Red Interinstitucional UNIDESARROLLO integrada por las Universidades Nacionales de Lujan, de General Sarmiento, de San Martin, de Jose C. Paz y Universidad Tecnológica Nacional Sede Gral. Pacheco.
Asimismo, ha suscrito varios acuerdos y convenios con otras instituciones universitarias y no universitarias, en el orden nacional e internacional con el fin de contribuir al logro de sus cometidos estatutarios.
Un objetivo importante de la UNM es impulsar políticas de alianza estratégica con universidades e instituciones científicas del exterior, especialmente, de la región UNASUR. Este trabajo es responsabilidad de la Dirección de Relaciones Internacionales, que tiene como tareas específicas promover la participación de la Universidad en redes internacionales; alentar el intercambio entre docentes y estudiantes y dar a conocer la UNM en el resto del mundo.